經濟邏輯貫穿始終，這是俄羅斯轉型以來整個高等教育政策的特點。早在1992年，俄羅斯教育法就允許教育機構進行有償教育服務。1996年俄羅斯教育法規定，公立機構可以招收自費生，有權出租土地（但所獲租金應用于教育事業），可以從事各類經營性活動，包括銷售、出租校產、提供中介服務、參與股份制公司、購買股票等有價證券、開辦校辦產業。俄羅斯高等教育改革背后的經濟邏輯并不讓人奇怪，因為俄羅斯高等教育改革的智庫，就是一個徹頭徹尾的經濟機構——經濟高等學院。要對俄羅斯高等教育政策有個大致了解，經濟高等學院是一個繞不開的話題。
經濟高等學院在俄羅斯頂尖大學俱樂部中屬于國家研究大學之列，也是2013年競爭勝出的15所沖刺世界一流大學之一。1997年，當時的院長楊若斯拉夫·庫茲米諾夫開展教育經濟研究，試圖最優化教育經濟，而此前還沒有人這么做過。從一攬子撥款改為按學生人頭撥款，從一視同仁資助所有學生，轉變為僅僅面向優秀學生提供大額獎學金，這兩個教育財政政策變化都源于上述研究。1998年8月經濟危機之后，弗拉迪米爾·菲利普夫被任命為教育部部長，正是在那時，經濟高等學院成為俄羅斯教育改革的智庫。
經濟高等學院本身就是俄羅斯高等教育改革的先鋒。前院長楊若斯拉夫·庫茲米諾夫曾宣布，所有由經濟高等學院提出的改革必須首先在自己身上實驗。在上世紀90年代早期，當所有其他俄羅斯大學繼續教授官方政治經濟學時，經濟高等學院就已經采用最新的國外教科書，教授宏觀經濟學與微觀經濟學，同時從專家系統向“學士加碩士”系統轉變。經濟高等學院還改革獎學金、工資以及研究經費辦法以刺激科研。2001年，俄羅斯展開統一國家考試的實驗，經濟高等學院一馬當先，將國家統一考試作為唯一招生標準。而直到2008年，國家統一考試才成為所有俄羅斯大學的強制性標準。
新的教育與科學部長安德瑞·福森科宣稱與專家組織保持距離。盡管如此，在國家教育政策制定方面，經濟高等學院依然地位不減，它的教育分析報告被視為參考書，影響力舉足輕重。一個例證是，安德瑞·福森科的一個主要觀點是教育系統不能是“它自己的事情”——高等教育和中等學校必須與公民社會的形成一塊考慮，職業教育尤其要考慮用人單位的要求，商業代表有必要在決定課程與質量評估方面發出聲音。事實上，這一觀點源自經濟高等學院社會經濟發展研究中心主任安拉托利·品斯基的“治理董事會”理念——在治理董事會中，公共代表具有真實的權力，從課程內容到教師的聘用方面都具有發言權，大學通過治理董事會向社會公開透明化。
俄羅斯2005年以來的企業化大學改革是經濟邏輯的直接產物。目前還沒有正式的評估方式來衡量學界、業界與政府之間的三邊合作，不過，一些跡象已顯示經濟邏輯與行政指令的無力。
首先，公司對研發往往投入不足。2008年至2009年財政危機導致許多公司削減了與大學合作的力度，與大學合作公司的比例從2008年的44%減少為2012年的33%。在經濟危機的尾聲，形勢逐步好轉，合作公司比例回升到2008年水平，但回升部分主要是“消極”合作——更少的財政投資，更多的形式性介入（如公司“開放日”或“工作市場”）。
國家通過稅收減免以及直接資助，固然促進了大學與企業的合作，但一些人認為，依賴預算資源可能會使得公司與大學的科研合作往往徒具形式：雙方真正共同展開的科研項目很少，公司和大學秘而不宣的目標是獲得政府資助，而真正的目標退居其次，改革的精神并未得到尊重。事實上，大學與科研/創新之間的割離依然持續，大學在計算工資的時候，教學和科研都是分開來計算。
對于大學來說，盡管成立了商業孵化器、技術公園、智力財產中心、專家與證書中心、創業公司，但由于蘇聯時期的遺產——教學與科研分離，加上轉型時期的人才流失，大學的科研水平低下，其所謂的創新與服務有時很成問題，表現為無法滿足商業需求，大學創立的中小型公司年度營業額往往是負數。這使得俄羅斯科學院在滿足企業需求方面經常獨擋一面。